在膝蓋上長有骨刺，上樓梯下蹲都會很疼，

這沒有什麼所謂的最好治療方法，因為骨刺本身就是正常的機體退變過程，與關節磨損有關係，沒有能夠完全治癒的方法，平時可以進行對症處理，做熱敷按摩，外用膏藥，用烤燈照射，疼痛嚴重可以服用，雙氯芬酸鈉緩釋膠囊，另外可以服用骨刺消痛丸，如果是影響到關節行走，症狀特別嚴重，可以通過手術進行清理。

您好，骨刺本身沒有很好特的特效藥物，如果症狀明顯，可以考慮是否有手術機會。