我的奶奶是他爺爺的親妹妹

直系血親和三代以內的旁系血親禁止結婚。你們是第三代所以不能結婚的。

這個情況屬於近親的，近親結婚是指三代及三代以內有共同的祖先，所以你的奶奶和她的爺爺是有共同的祖先，所以這個是絕對不能結婚的，如果結婚了，將來生下的孩子很容易發生各種遺傳性疾病，所以對身體的影響是存在的，需要注意的，建議重新找到合適的物件，避免將來生下不健康的孩子，所以在平時需要注意的。