腦脊液檢查常用於鑒別

典型結腦腦脊液壓力增高，外觀無色透明或呈毛玻璃樣，若蛛網膜下腔阻塞時，腦脊液呈黃色。腦脊液白細胞多在（50～500）×l06/L，分類以淋巴細胞為主。急性進展期、腦膜病灶或結核瘤破潰時，白細胞可＞l 000×l06 /L，可以中性粒細胞為主，與化膿性腦膜炎相似。糖含量常明顯減少，氯化物含量降低。

蛋白含量增高，一般多在 l～3g/L，椎管阻塞時可高達10～50g/L。腦脊液靜置12～24小時後，可見網狀薄膜形成，取之塗片行抗酸染色檢查，結核菌檢出率較高。結核菌培養或豚鼠接種陽性具有確診意義，但因需時較長，不適於早期診斷。