我停經兩周了,最近有出現咖啡色的分泌物

b超沒有看到妊娠物的話是要考慮宮外孕的。不過是也可能是正常妊娠。
你最好不要頻繁b超，也許會對妊娠不利的。用試紙檢測，陽性的話就是懷孕，再過1個月再做b超，還要保胎治療。

您的情況單從症狀還不好判斷，建議您還是儘早去醫院檢查一下，及早確診並針對原發病因治療，以免延誤病情，祝您早日康復！